Знание IVD Principles & Technologies Как можно исследовать нуклеиновые кислоты с помощью двойных хемилюминесцентных систем (HRP/AP) без удаления зондов (стриппинга)? Освоение последовательного детектирования
Аватар автора

Техническая команда · CamelBio

Обновлено 1 месяц назад

Как можно исследовать нуклеиновые кислоты с помощью двойных хемилюминесцентных систем (HRP/AP) без удаления зондов (стриппинга)? Освоение последовательного детектирования


Избегайте разрушительных протоколов стриппинга, которые ставят под угрозу ваш ценный образец.
Двойная ферментно-субстратная хемилюминесцентная система с использованием пероксидазы хрена (HRP) и щелочной фосфатазы (AP) позволяет последовательно исследовать несколько мишеней нуклеиновых кислот на одной мембране без необходимости их удаления. Путем одновременной гибридизации двух зондов с разными метками — например, биотинилированного зонда и зонда, меченного дигоксигенином — вы детектируете первую мишень с помощью HRP/люминола, необратимо инактивируете активность HRP простой промывкой перекисью водорода, а затем проявляете вторую мишень с помощью AP. Этот подход сохраняет иммобилизованные нуклеиновые кислоты и обеспечивает получение чистых количественных результатов с одного блота.

Главное: Секрет заключается в короткоживущем хемилюминесцентном сигнале HRP и его чувствительности к инактивации перекисью. После получения первого изображения промывка H₂O₂ полностью разрушает остаточную активность HRP, не повреждая мишени, связанные с мембраной. Затем вы можете добавить реагент для детектирования, конъюгированный с AP, и получить стабильный, длительный сигнал для второй мишени — и все это без удаления зондов с мембраны.

Проблема традиционного стриппинга мембран

Многократное исследование одной и той же мембраны обычно требует жесткой стадии стриппинга между циклами детектирования, что создает значительные риски, способные подорвать результаты вашего эксперимента.

Деградация и потеря мишеней

Растворы для стриппинга (часто высокотемпературные, содержащие SDS или имеющие низкий pH) могут физически удалять или химически разрушать нуклеиновые кислоты, зафиксированные на мембране. Для низкокопийных транскриптов или ценных образцов даже потеря 10–20% за цикл может привести к исчезновению биологически значимого сигнала.

Неоднозначные и вариативные результаты

Неполный стриппинг оставляет остатки зонда или конъюгата для детектирования, вызывая появление «ложных полос», которые затрудняют последующий анализ. Степень стриппинга трудно воспроизвести точно, что приводит к плохой согласованности между блотами и делает количественные сравнения практически невозможными.

Затраты времени и труда

Процесс стриппинга, повторного блокирования и повторной гибридизации требует много времени и постоянной оптимизации. Метод последовательного использования двух ферментов сокращает весь рабочий процесс до двух быстрых этапов детектирования, выполняемых на одном блоте без использования реагентов для стриппинга.

Как работает стратегия двойной ферментно-субстратной системы

Этот метод использует ортогональные ферментативные свойства HRP и AP для последовательной визуализации двух мишеней после одной одновременной гибридизации.

Шаг 1: Одновременная гибридизация с двумя разными зондами

Вы готовите два зонда для нуклеиновых кислот, каждый из которых нацелен на свою последовательность, и метите их разными гаптенами. Классическая комбинация — это биотинилированный зонд и зонд, меченный дигоксигенином. Оба зонда добавляются в буфер для гибридизации одновременно, поэтому они связываются со своими мишенями за один этап. Это устраняет необходимость в последовательных гибридизациях и обеспечивает одинаковые условия для обеих мишеней.

Шаг 2: Быстрое детектирование первой мишени с помощью HRP и люминола

После отмывки мембрана инкубируется с конъюгатом авидин-HRP (или стрептавидин-HRP), который специфически связывается с биотинилированным зондом. Затем вы наносите хемилюминесцентный субстрат на основе люминола (например, ECL). HRP катализирует окисление люминола, создавая быструю вспышку света, которая фиксируется на пленке или цифровом имиджере. Сигнал HRP-люминола является кратковременным, обычно затухающим в течение нескольких минут, что на самом деле является преимуществом — это позволяет перейти к следующему шагу без остаточного свечения.

Шаг 3: Инактивация активности HRP без повреждения мембраны

После получения первого изображения необходимо полностью инактивировать весь фермент HRP на мембране. Это делается путем инкубации мембраны в растворе перекиси водорода (обычно 0,5–2% H₂O₂) в течение 20–30 минут при комнатной температуре.

Почему это работает: Перекись окисляет железо гема в активном центре HRP, необратимо разрушая каталитическую способность фермента. Поскольку H₂O₂ — это просто вода с дополнительным атомом кислорода, она не удаляет нуклеиновые кислоты с мембраны и не изменяет дуплексы мишень-зонд. После инактивации тщательно промойте мембрану, чтобы удалить остатки перекиси перед продолжением.

Шаг 4: Стабильное детектирование второй мишени с помощью AP

Теперь вы добавляете второй конъюгат для детектирования — антитела к дигоксигенину, сопряженные со щелочной фосфатазой. Поскольку HRP полностью инактивирована, риск перекрестной реактивности отсутствует. После отмывки от несвязанного конъюгата вы наносите хемилюминесцентный субстрат, специфичный для AP (например, CDP-Star или CSPD). AP генерирует устойчивый, светящийся сигнал, который достигает плато и остается стабильным в течение нескольких часов, давая вам достаточно времени для многократных экспозиций и оптимальной визуализации. Результатом является второе, независимое хемилюминесцентное изображение с той же мембраны, без намека на сигнал первого зонда.

Понимание компромиссов

Этот подход с использованием двух ферментов эффективен, но его успех зависит от тщательного выполнения. Несоблюдение следующих нюансов может привести к высокому фону или ложноположительным сигналам.

Обеспечение полной инактивации HRP

Если после промывки перекисью останется хотя бы след активной HRP, она снова «загорится» при добавлении субстрата AP (особенно если буфер субстрата AP содержит стабилизатор перекиси или если мембрана позже подвергается воздействию реагента на основе перекиси). Признаки неполной инактивации включают: слабое повторное появление полос первой мишени на втором изображении или диффузное «потемнение» мембраны. Всегда проверяйте протокол инактивации, выполняя контрольное проявление: обработайте мембрану, где была HRP, перекисью H₂O₂, затем нанесите субстрат AP и сделайте снимок — сигнал не должен появиться.

Перекрестная реактивность и конъюгаты зондов

Авидин-HRP не должен распознавать зонд с дигоксигенином, а анти-дигоксигенин-AP не должен реагировать с биотином. Стандартные коммерческие реагенты обладают высокой специфичностью, но разумно проводить контрольные блоты с одним зондом, чтобы подтвердить отсутствие перекрестной реактивности. Кроме того, некоторые блокирующие агенты (например, молоко) могут быть источником эндогенного биотина, вызывая фон при использовании конъюгатов авидина; при необходимости перейдите на блокирующий буфер, не содержащий биотина.

Время и затухание хемилюминесцентного сигнала

Сигнал HRP-люминола необходимо фиксировать сразу после добавления субстрата, так как он быстро достигает пика и затухает. Это не является недостатком для самого последовательного детектирования, но требует, чтобы вы находились у прибора сразу после добавления субстрата. Задержка первой экспозиции может привести к тому, что вы пропустите слабые полосы, а затем непреднамеренно «увидите» их позже, если активность HRP не полностью затухла — это может ввести в заблуждение, заставив думать, что инактивация требовалась раньше. Работайте быстро и подтвердите затухание сигнала перед переходом к инактивации.

Стоимость и работа с реагентами

Поддержание двух ферментно-субстратных систем означает покупку двух наборов конъюгатов и субстратов, а также потенциальную корректировку состава буферов. Субстраты AP требуют щелочной среды (pH ~9,5), поэтому после этапа инактивации HRP необходимо уравновесить мембрану в буфере для AP. Этот дополнительный обмен буфера добавляет несколько минут к протоколу, но критически важен для оптимальной активности AP.

Правильный выбор для вашей цели

Эта стратегия двойного детектирования не является универсальным решением. Согласуйте свой подход с приоритетами эксперимента.

  • Если ваша главная цель — сохранить каждый нанограмм ценного образца: Выберите метод последовательного использования HRP/AP. Он устраняет неопределенность и потерю образца, связанные со стриппингом, что делает его идеальным для биопсий пациентов или ограниченных полевых образцов.
  • Если ваша главная цель — детектировать одну низкокопийную и одну высококопийную мишень: Назначьте менее обильную мишень на канал AP. Длительное свечение субстратов AP позволяет накапливать сигнал за счет увеличенной экспозиции, выявляя слабые полосы, которые могут быть пропущены при кратковременном сигнале HRP.
  • Если ваша главная цель — количественная оценка обеих мишеней с высокой точностью: Используйте цифровую визуализацию и убедитесь, что два хемилюминесцентных сигнала остаются независимыми. Проведите контроль, исключив первый зонд, и подтвердите отсутствие сигнала на изображении AP, гарантируя, что остаточная активность HRP не влияет на второе измерение.
  • Если ваша главная цель — мультиплексирование трех и более мишеней: Примите во внимание ограничение — этот метод предназначен строго для двух мишеней. Для более сложного мультиплексирования более практичным выбором являются зонды с флуоресцентными метками.

Когда вам действительно нужно сохранить мембрану и вы исследуете только две последовательности нуклеиновых кислот, стратегия двойного детектирования HRP/AP дает вам окончательные ответы без стриппинга с надежностью, которой заслуживают ваши результаты.

Сводная таблица:

Этап рабочего процесса Мишень детектирования Ферментно-субстратная система Ключевое эксплуатационное преимущество
1. Одновременная гибридизация Двойная мишень (например, Биотин и DIG) Н/Д Одностадийная гибридизация сохраняет целостность мишени и обеспечивает равные условия связывания.
2. Детектирование первой мишени 1-я мишень нуклеиновой кислоты Стрептавидин-HRP + Люминол Генерирует быстрый, высокоинтенсивный кратковременный сигнал для немедленной первичной визуализации.
3. Инактивация перекисью HRP, связанная с мембраной Промывка 0,5–2% H₂O₂ Необратимо инактивирует каталитическую активность HRP без стриппинга или повреждения нуклеиновых кислот.
4. Детектирование второй мишени 2-я мишень нуклеиновой кислоты Анти-DIG-AP + Субстрат AP Создает устойчивое, стабильное свечение для длительной экспозиции и чувствительной количественной визуализации.

Масштабируйте свои молекулярные анализы с помощью высокопроизводительных IVD-решений

Разработка чувствительных и воспроизводимых протоколов детектирования требует стабильных, высокочистых ферментных конъюгатов и надежных реагентов. CamelBio предоставляет производителям диагностических систем, клиническим лабораториям и научно-исследовательским институтам доступ к премиальному сырью для IVD, специализированным техническим услугам и консультациям по вопросам регулирования — на каждом этапе разработки анализа, от концепции до клиники.

Независимо от того, требуются ли вам первоклассные конъюгаты HRP/AP, реагенты для детектирования на заказ или поддержка в оптимизации протоколов, мы стремимся повысить эффективность вашей диагностики. Свяжитесь с нами сегодня, чтобы ознакомиться с полным ассортиментом продукции и получить экспертную техническую поддержку!


Оставьте ваше сообщение